Leurs noms se ressemblent, mais le cresson de fontaine et le cresson alénois diffèrent clairement en goût et en usage. Le cresson de fontaine a des feuilles rondes, pousse dans l’eau et a une saveur fraîche et piquante, un peu poivrée. Le cresson alénois a de fines tiges avec de petites feuilles et un goût plus prononcé, rappelant la moutarde. Le cresson de fontaine se consomme souvent en salade ou en soupe, tandis que le cresson alénois est apprécié comme garniture relevée sur du pain ou dans des plats.